https://dspace.piwet.pulawy.pl/xmlui/handle/123456789/5 2026-07-30T17:55:50Z https://dspace.piwet.pulawy.pl/xmlui/handle/123456789/967 Zmienność genetyczna wirusa grypy ptaków u różnych gatunków drobiu Dziadek, Kamila Natalia Grypa ptaków (AI, ang. avian influenza) jest jedną z najważniejszych jednostek chorobowych drobiu i ptaków wolno żyjących, która widnieje na liście chorób Światowej Organizacji Zdrowia Zwierząt (WOAH, ang. World Organisation for Animal Health). Wybuchy ognisk AI pociągają za sobą ogromne straty materialne dla sektora drobiarskiego i powiązanych z nim gałęzi przemysłu, a ponadto stanowią narastające zagrożenie dla zdrowia publicznego. Czynnikiem etiologicznym AI jest wirus grypy ptaków (AIV) typu A –Alphainfluenzavirus z rodziny Orthomyxoviridae – charakteryzujący się wysoką zmiennością genetyczną. Jako wirus RNA o segmentowanym genomie, AIV nieustannie podlega dwóm podstawowym mechanizmom zmienności – dryfowi genetycznemu i reasortacji. Oba ww. mechanizmy warunkują stałą ewolucję wirusa, która może prowadzić do nabywania nowych cech adaptacyjnych, a nawet przełamywania barier międzygatunkowych. Wyróżnia się dwie formy AIV: nisko zjadliwą (LPAIV) oraz wysoce zjadliwą (HPAIV), a stosowana klasyfikacja opiera się na zdolności wirusa do wywoływania choroby w modelu in vivo – u kur. Przemiana LPAIV do formy HPAIV jest możliwa w wyniku spontanicznej mutacji w miejscu cięcia hemaglutyniny (HACS, ang. haemagglutinin cleavage site). Może do niej dojść np. w przypadku introdukcji LPAIV do drobiu na skutek kontaktu stada z naturalnymi gospodarzami i rezerwuarem AIV w środowisku – przedstawicielami rzędów blaszkodziobych i siewkowych. Śledzenie zmienności AIV w warunkach naturalnych oraz eksperymentalne badanie jej mechanizmów pozwala lepiej zrozumieć dynamikę epidemii, w tym proces przełamywania barier międzygatunkowych, stanowiąc element wczesnego ostrzegania przed pojawianiem się wariantów potencjalnie niebezpiecznych dla zwierząt i ludzi. Wyniki badań uzyskane w ramach rozprawy doktorskiej sugerują, że konieczne jest wzmocnienie monitoringu AIV w populacji wolno żyjącej, który będzie obejmować wykrywanie oraz analizę genomową nie tylko HPAIV, ale również LPAIV. W tym zakresie należy położyć szczególny nacisk na identyfikację i śledzenie markerów genetycznych o potencjale funkcjonalnym. Ponieważ mechanizmy adaptacji AIV pozostają w dużej mierze niepoznane, zasadne wydaje się również kontynuowanie badań nad ewolucją wirusów AI. Niemniej jednak, konieczne jest uwzględnienie czynników immunologicznych gospodarza. 2025-01-01T00:00:00Z https://dspace.piwet.pulawy.pl/xmlui/handle/123456789/966 Evolutionary dynamics of the multidrug-resistant Salmonella Infantis harbouring the pESI megaplasmid across Europe Alba, Patricia; Diaconu, Elena Lavinia; Carfora, Virginia; Battisti, Antonio; Franco, Alessia; Ceyssens, Pieter-Jan; Graells- Garcia, Cristina; Schau Slettemeås, Jannice; Zając, Magdalena; Skarżyńska, Magdalena; Wasyl, Dariusz; Clemente, Lurdes; Caniça, Manuela; Manageiro, Vera; Börjesson, Stefan; Franz, Eelco; Östlund, Emma; Söderlund, Robert; Garcia- Fernandez, Aurora; Villa, Laura Multidrug- resistant Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis clone, harbouring the pESI megaplasmid, first described in Israel in 2014, is consistently reported in poultry and humans worldwide. This study aimed to investigate the genomic epi- demiology of S. Infantis collected by nine European Public Health Institutions from samples of different origins (human, food and animal sources) and understand the evolutionary dynamics of pESI-like in Europe. The resolved pESI-like sequences have also been compared with complete publicly available pESI-like sequences from other countries, in a One Health context. The circulation of a S. Infantis clone in Europe carrying the mosaic megaplasmid pESI-like has been associated with resistance to sulphonamides (sul), tetracycline (tet), streptomycin and spectinomycin (aadA1). In recent years, blaCTX- M- 1- positive pESI- like plasmids have been increasingly detected in the extended-spectrum beta-lactamase- producing S. Infantis clone. Using a com- bined short- and long-read sequencing approach, two main types of pESI variants have been identified, differing in the acces- sory gene content, including the blaCTX- M variant, indicating a certain stability of pESI variants detected in different geographical regions and sources over time (2011–2021). Moreover, the differences were related to the acquisition of resistance, virulence or fitness- enhancing genes that would potentially benefit the Salmonella host. 2026-01-01T00:00:00Z https://dspace.piwet.pulawy.pl/xmlui/handle/123456789/965 Abequose-containing O-antigen polysaccharide from Aeromonas sobria K221 (serogroup PGO1): structure, O-antigen gene cluster correlation, and Abe-transferase prediction Turska-Szewczuk, Anna; Dworaczek, Katarzyna; Bomba, Arkadiusz; Kubaczyńska, Maria; Drzewiecka, Dominika; Iwan, Ewelina; Kamińska, Ewelina; Pękala-Safińska, Agnieszka Aeromonas species are important opportunistic pathogens in freshwater aquaculture, including Polish fish farms, where outbreak-associated isolates have been assigned to local provisional serogroups. Among these, PGO1 is frequently detected, but the structural and genetic diversity of the corresponding O-specific polysaccharides remains poorly understood. Here, we characterized Aeromonas sobria strain K221, a PGO1 isolate recovered from common carp during an outbreak of motile Aeromonas infection/septicaemia. The O-specific polysaccharide (OPS), isolated from LPS, was analysed by chemical methods and 1H/13C NMR spectroscopy, and its O-repeating unit was identified as a linear pentasaccharide containing β-GlcpNAc, 2-O-acetylated α-Rhap, and α-Abep resi- dues. Bioinformatic analysis of the O-antigen gene cluster (OGC) revealed gene content consistent with the OPS structure and supported functional assignment of the biosynthesis locus, including a putative α-1,3-CDP-abe- quosyltransferase. Both the OPS and its OGC differed from those of other recently characterized PGO1 strains, indicating that K221 represents a distinct variant within this serogroup. The occurrence of 2-substituted abe- quose, not previously reported in Aeromonas O-polysaccharides or as a 2-substituted residue in bacterial O- polysaccharides, highlights an unusual structure–biosynthesis relationship. These findings reveal greater struc- tural and genetic diversity within the Aeromonas PGO1 serogroup than previously recognized and expand current knowledge of bacterial O-specific carbohydrate polymers. 2026-01-01T00:00:00Z https://dspace.piwet.pulawy.pl/xmlui/handle/123456789/964 MGF110-2L deletion prevents IFN-I and inflammatory response, resulting in partial attenuation and protection against virulent ASFV Gata-de-Benito, Julia; Walczak, Marek; Liu, Lihong; Vigara-Astillero, Gonzalo; Szymankiewicz, Krzesimir; Kochanowski, Maciej; Żmudzki, Jacek; Revilla, Yolanda; Pérez-Núñez, Daniel African swine fever virus (ASFV) encodes numerous multigene family (MGF) proteins whose individual contributions to virulence and immune modulation remain poorly understood. Here, we characterize the role of MGF110-2L in shaping innate immunity and disease outcome in vivo. Deletion of MGF110-2L from the virulent Arm/07/CBM/c2 isolate markedly attenuated clinical disease and conferred complete protection against homologous challenge. In macrophages, the MGF110-2L-deficient recombinant induced enhanced type I interferon (IFN) responses, consistent with a role for MGF110-2L in antagonizing antiviral signaling. However, transcriptomic profiling of peripheral blood mononuclear cells revealed that the absence of MGF110-2L prevents the excessive IFN and inflammatory hyperactivation triggered by the parental virus in vivo, establishing a controlled antiviral program associated with reduced pathology. These findings identify MGF110-2L as a functional virulence factor that drives dysregulated innate immune responses during ASFV infection. Our work advances the molecular understanding of ASFV-host interactions and highlights the contribution of MGF110-2L protein to immune evasion and pathogenesis. IMPORTANCEFinding safe and effective vaccines is essential to impair the spread of African swine fever virus (ASFV), responsible for the largest animal pandemic. Identifying ASFV virulence factors and understanding the mechanisms of pathogenesis and protection are crucial. By using RNAseq from in vivo peripheral blood mononuclear cells, together with immunological studies, we showed that MGF110-2L regulates type I IFN production and cytokine storm in pigs. Deletion of the MGF110-2L gene results in attenuation and induces protection against the parental virulent strain. These results support the induction of an alert immune state together with dampened systemic inflammation but preserved cytotoxic readiness in vaccinated animals. Altogether, our data shed light on the mechanisms underlying protection against ASFV and contribute to the development of new protective tools. 2026-01-01T00:00:00Z